L'Hôtel-Dieu d'Auxerre existait avant le XIIe siècle (date de fondation inconnue). Administré à l'origine par le chapitre de la cathédrale, il fut d'abord desservi par des Augustins du prieuré de Saint-Amatre, et à partir de 1480 par des Franciscaines. Puis en 1643 l'évêque Pierre de Broc y organisa une communauté d'Hospitalières avec des Augustines venues de Bourges, qui furent expulsées à la Révolution
Hôtel-Dieu d'Auxerre, fondé au 12e siècle, portait consécutivement les noms de la Maison-Dieu, hôpital des Grandes-Charités et hôpital de la Madeleine. La Maison-Dieu, située près du cimetière de Montartre (Mons autricus, altricus), faisait partie des Grandes-Charités.
